При выборе респираторной панели лаборатории нужны ответы на конкретные вопросы: какие вирусы она выявляет, с каким материалом работает и подойдёт ли для имеющегося оборудования. Разберём ARVI-TEST-MAX по этим параметрам.
ARVI-TEST-MAX определяет РНК и ДНК возбудителей респираторных вирусных инфекций. В набор входят пять праймер-миксов: PIV, CoV, ARP, RMB и SAB.
| Праймер-микс | Выявляемые вирусы | Что различает исследование |
|---|---|---|
| PIV | Вирусы парагриппа 1, 2 и 4 | Каждый из трёх типов определяется отдельно |
| CoV | Коронавирусы NL63, 229E и HKU1/OC43 | NL63 и 229E определяются отдельно; HKU1 и OC43 — совместно, без различения между ними |
| ARP | Аденовирусы, риновирусы и вирус парагриппа 3 | Каждая из трёх мишеней определяется отдельно |
| RMB | Респираторно-синцитиальный вирус A/B, метапневмовирус A/B и бокавирусы | RSV A и B не различаются между собой; метапневмовирусы A и B также выявляются совместно |
| SAB | SARS-CoV-2, вирусы гриппа A и B | SARS-CoV-2 выявляется одновременно по двум мишеням. Грипп A, грипп B и SARS-CoV-2 определяются отдельно; подтипы гриппа A и линии гриппа B не различаются |
Таким образом, результат позволяет различать предусмотренные панелью вирусы или их группы, но не во всех случаях — отдельные типы внутри группы. Например, положительный результат HKU1/OC43 не уточняет, какой из двух коронавирусов обнаружен.
Большинство мишеней панели — РНК вирусов. Перед амплификацией обратная транскриптаза преобразует их в комплементарную ДНК. Для ДНК аденовирусов и бокавирусов этот этап не нужен.
Обратная транскрипция и амплификация проходят в рамках одной программы. ОТ-ПЦР-буфер содержит необходимые ферменты, дезоксинуклеозидтрифосфаты и буферные компоненты.
Для работы с ARVI-TEST-MAX используются «НК-ЭКСТРА», «НК-ЭКСТРА-SW» и «МАГНО-сорб». Выбор зависит от материала.
| Набор для выделения | Материал |
|---|---|
| «НК-ЭКСТРА», ТестГен | Мазки из носоглотки и ротоглотки, мокрота |
| «НК-ЭКСТРА-SW», ТестГен | Мазки из носоглотки и ротоглотки |
| «МАГНО-сорб», АмплиСенс | Мазки из носоглотки и ротоглотки, эндотрахеальный аспират, мокрота, бронхоальвеолярная лаважная жидкость |
Например, для исследования эндотрахеального аспирата или бронхоальвеолярной лаважной жидкости из этого перечня подходит «МАГНО-сорб». Для мазков из носоглотки и ротоглотки предусмотрены все три варианта.
Выделение можно проводить вручную или автоматически. Для автоматизированной работы предусмотрен KingFisher Flex. Объём элюции составляет 90 мкл при ручном выделении и 110 мкл при автоматическом. При подготовке постановки используют протокол для выбранного сочетания материала, реагентов и оборудования.
ARVI-TEST-MAX применяется на следующих приборах:
Целевые сигналы регистрируются по каналам FAM/Green, ROX/Orange и Cy5/Red. Канал HEX/Yellow используется для внутреннего контроля. Для каждого прибора применяются соответствующие программа амплификации и настройки анализа.
Панель рассчитана на совместное использование всех пяти мультиплексов. ПЦР/ОТ-ПЦР занимает 80–110 минут в зависимости от амплификатора. Выделение нуклеиновых кислот и подготовка постановки в это время не входят.
В комплект входят три контрольных образца:
Положительный контрольный образец (ПКО) содержит контрольные молекулы нуклеиновых кислот с последовательностями выявляемых вирусных мишеней. Он нужен для проверки работы реакций.
Отрицательный контрольный образец (ОКО) помогает обнаружить контаминацию — попадание посторонних нуклеиновых кислот при выполнении исследования.
Внутренний контрольный образец (ВКО) проходит выделение вместе с исследуемой пробой. По его сигналу оценивают эффективность выделения и возможное ингибирование обратной транскрипции и амплификации.
Контроли позволяют отличить отсутствие вирусной мишени от ситуации, когда исследование не дало достоверного результата.
ARVI-TEST-MAX выдаёт качественный результат: нуклеиновая кислота соответствующего вируса обнаружена либо не обнаружена в пределах чувствительности метода. Значение Ct используется для интерпретации, но не является количественным измерением вирусной нагрузки.
Отрицательный результат относится только к мишеням панели. Он не исключает другие причины респираторного заболевания. Положительный результат врач оценивает вместе с симптомами, анамнезом и другими данными обследования.
Подбираете респираторную панель для своей лаборатории? Сообщите специалистам «ТестГен», с каким материалом и оборудованием вы работаете: поможем уточнить подходящий вариант выделения и требования к постановке.
Подробнее — в карточке ARVI-TEST-MAX.
Телефон: 8 800 350-13-01
Электронная почта: sale@testgen.ru
Разработка сайта